HYDE — 原子级亲和力打分
SeeSAR 的核心引擎，让每一个设计决策都有据可依
看见每个原子的贡献
HYDE 基于去溶剂化感知的自由能（ΔG）估算，实时计算每个原子对整体结合亲和力的贡献。绿色代表有利贡献，红色代表不利 — 一目了然。
- 原子级分辨率 — 精确到单个原子的能量贡献
- 去溶剂化惩罚可视化 — 识别结合中的隐形代价
- 扭转角“交通灯” — 了解结构的合理性
- 实时反馈 — 编辑分子时即时更新打分
灵感模式 (Inspirator)
分子设计的灵感火花发生器
骨架替换 · 片段生长/连接 · 类似物生成
Inspirator 模式是您分子设计环节的最佳搭档。它提供骨架替换和化合物修饰建议，您跳出思维定式。
- 骨架替换 — 浏览数千万高质量 3D 骨架，快速发现新颖的骨架结构
- 基于片段的药物发现 — 从片段出发构建新分子，加速先导化合物优化
- 类似物生成 — 290 种常用药物化学转化自动采样
片段药物设计 (FBDD)
从最小的分子开始，构建最强的候选药物
片段生长 (Growing)
FastGrow 引擎秒级筛选数百万片段构象。5 大专业库 · 87 万+ 片段：默认 12k / 药化 120k / sp³ 28k / 铰链 51k / 二肽 661k。
片段连接 (Linking)
ReCore 为分处不同子口袋的片段找到几何最优连接骨架。免费索引 ZINC / PDB / Magic Rings（1500 万+ 片段）开箱即用。
片段融合 (Merging)
ReCore 对有重叠区域的片段进行核心替换与合并，生成兼具双方结合特征的新骨架。骨架跃迁、专利规避、移除不良基团的利器。
分子对接
从标准对接、基于模板分子的对接到共价对接，覆盖所有场景
构象生成与全方位评估
预测配体在靶标结合位点的结合模式，通过直观的交通灯系统即时理解对接结果的质量。
- 标准对接 — FlexX 引擎驱动的高精度分子对接
- 模板对接 — 基于已知结合模式的引导式对接
- 共价对接 — 自动检测 36 种共价弹头，考虑所有立体异构体
- 药效团约束 — 精细调控对接结果的特征分布
内置超大规模筛选
从 SeeSAR 界面一键启动十亿级虚拟筛选
Chemical Space Docking
直接在 SeeSAR 中对万亿级组合化学空间进行基于结构的虚拟筛选。只需连接本地 CPU 服务器即可运行。命中分子可合成性高达80%化合物，可直接向供应商采购。
了解 CSD 技术HPSee 高性能计算支持
通过 SeeSAR 连接外部服务器，一键将大规模虚拟筛选任务提交到远程 HPC 集群。完成后只需下载排名靠前的结果在本地评估 — 告别 TB 无效数据。
没有靶点结构？一样能做
基于配体的虚拟筛选与 3D 分子比对
Similarity Scanner 3D — 基于配体的虚拟筛选
基于相互作用特征、体积和形状将分子与模板结构进行 3D 比对。FlexS 算法提供排序分数，帮助您选择最佳候选物。
- 3D 药效团特征匹配（氢键供体/受体 + 分子形状）
- 骨架跃迁和功能基团替换的理想工具
- 可施加药效团约束精细调控结果
Activity Spotter — 活性特征提取
从一组已知活性/非活性分子中提取关键的 3D 活性特征。识别正面和负面贡献因子，捕捉生物活性的核心驱动力。生成的活性位点可作为药效团约束，用于后续虚拟筛选或指导化合物优化决策。
功能全景
药物发现的瑞士军刀
化合物创意与设计
对接与打分
靶标与蛋白处理
分析与展示
适用人群
计算化学家
命令行组件 (FlexX, HYDE, FlexS, FastGrow) 可独立运行在服务器或云端，支持自动化流程集成。
药物化学家
直觉化的可视界面让实验化学家无需编程即可进行分子设计、打分评估和虚拟筛选。
教学与科研
Fast · Visual · Easy 的设计理念让 SeeSAR 成为计算化学教学和学术研究的理想工具。