SeeSAR

药物设计的日常工作台 — Fast · Visual · Easy

集分子对接、结构编辑、片段生长、片段连接、骨架跃迁、ADMET预测、Chemical Space Docking 等于一体的 3D 交互式药物设计平台。

SeeSAR 用户界面
15最新版本(Apollo)
36 种内置共价弹头类型
万亿级Chemical Space Docking 筛选规模
秒级片段生长结果返回

HYDE — 原子级亲和力打分

SeeSAR 的核心引擎,让每一个设计决策都有据可依

看见每个原子的贡献

HYDE 基于去溶剂化感知的自由能(ΔG)估算,实时计算每个原子对整体结合亲和力的贡献。绿色代表有利贡献,红色代表不利 — 一目了然。

  • 原子级分辨率 — 精确到单个原子的能量贡献
  • 去溶剂化惩罚可视化 — 识别被溶剂隐藏的问题
  • 分子扭转角交通灯 — 基于晶体结构数据库的统计分析
  • 实时反馈 — 编辑分子时即时更新打分
HYDE 打分 — 绿色有利/红色不利的原子级可视化

灵感模式 (Inspirator)

分子设计的灵感火花发生器

骨架替换 · 结合位点互补 · 类似物生成

Inspirator 模式是您分子设计环节的最佳搭档。它提供骨架替换和化合物修饰建议,帮助您跳出思维定式。

  • 骨架替换 — 浏览数千万高质量 3D 骨架,秒级发现新颖的支架结构
  • 结合位点互补 — 筛选数十万分子修饰以填充结合腔
  • 类似物生成 — 290 种常用药物化学转化自动采样
SeeSAR Inspirator 模式 — 分子设计灵感生成

片段药物设计 (FBDD)

从最小的分子开始,构建最强的候选药物

片段生长 (Growing)

FastGrow 引擎浏览数百万片段构象,秒级发现最佳的结合位点互补方案。内置 12,000 默认库 + 120,000 药物化学库。

片段连接 (Linking)

使用 ReCore 连接不同的片段结合体,精确考虑它们的 3D 位姿,找到几何最优的连接骨架。

片段融合 (Merging)

将重叠的结合基团合并,通过协同效应提升统一化合物的活性。

分子对接

从标准对接到共价对接,覆盖所有场景

位姿生成与全方位评估

预测配体在靶标结合位点的结合模式,通过直观的交通灯系统即时理解对接结果的质量。

  • 标准对接 — FlexX 引擎驱动的高精度分子对接
  • 模板对接 — 基于已知结合模式的引导式对接
  • 共价对接 — 自动检测 36 种共价弹头,考虑所有立体异构体
  • 药效团约束 — 精细调控对接结果的特征分布
SeeSAR 对接模式 — 位姿生成与评估

内置超大规模筛选

从 SeeSAR 界面一键启动十亿级虚拟筛选

Chemical Space Docking

直接在 SeeSAR 中对万亿级组合化学空间进行基于结构的虚拟筛选。无需枚举整个库,只需普通 CPU 服务器即可运行。所有命中分子均为可合成化合物,可直接向供应商采购。

了解 CSD 技术

HPSee 高性能计算支持

通过 SeeSAR 的外部对接模式,一键将大规模虚拟筛选任务提交到远程 HPC 集群。完成后只需下载排名靠前的结果在本地评估 — 告别 TB 级垃圾数据。

没有靶点结构?一样能做

基于配体的虚拟筛选与分子比对

Similarity Scanner 3D — 基于配体的虚拟筛选

基于相互作用特征、体积和形状将分子与模板结构进行 3D 比对。FlexS 算法提供排序分数,帮助您选择最佳候选物。

  • 3D 药效团特征匹配(氢键供体/受体 + 分子形状)
  • 骨架跃迁和功能基团替换的理想工具
  • 可施加药效团约束精细调控结果
SeeSAR 蛋白模式
SeeSAR 15 新功能

Activity Spotter — 活性特征提取

从一组已知活性/非活性分子中提取关键的 3D 活性特征。识别正面和负面贡献因子,捕捉生物活性的核心驱动力。生成的活性位点可作为药效团约束,用于后续虚拟筛选或指导化合物优化决策。

功能全景

药物发现的瑞士军刀

化合物创意与设计

Inspirator 灵感模式骨架替换片段生长 FastGrow片段连接 / 融合类似物采样即时分子编辑

对接与打分

FlexX 标准对接模板对接共价对接(36种弹头)HYDE 亲和力打分分子扭转角评估药效团约束

靶标与蛋白处理

结合位点检测结合位点比对蛋白编辑器支持蛋白/DNA/RNA直接下载 PDBYASARA 能量最小化

分析与展示

ADME 性质预测距离/角度测量3D 模型导出 (.glb)高分辨率截图标注与收藏SDF / Excel 输出明暗主题色盲模式

适用人群

计算化学家

命令行组件 (FlexX, HYDE, FlexS, FastGrow) 可独立运行在服务器或云端,支持自动化流程集成。

药物化学家

直觉化的可视界面让实验化学家无需编程即可进行分子设计、打分评估和虚拟筛选。

教学与科研

Fast · Visual · Easy 的设计理念让 SeeSAR 成为计算化学教学和学术研究的理想工具。

体验 SeeSAR

申请免费演示,了解 SeeSAR 如何加速您的药物设计流程。