产品总览
覆盖药物发现全流程的计算化学工具生态
BioSolveIT 围绕两大核心平台 — SeeSAR 与 infiniSee — 构建了从靶点验证到先导物优化的完整工具链。所有工具本地运行，数据完全可控。
两大核心平台
BioSolveIT 的所有工具围绕两个互补平台构建，覆盖结构导向设计与化学空间导航两条主线
SeeSAR
3D 药物设计平台面向药物化学家的一站式交互工作台。集成分子对接（FlexX）、亲和力打分（HYDE）、片段生长（FastGrow）、骨架跃迁（ReCore）、类似物生成（MedChemesis）等全套结构导向设计工具。
核心理念：Fast · Visual · Easy — 所见即所得的 3D 药物设计。
深入了解 SeeSAR →infiniSee
化学空间导航器万亿级化学空间的高速搜索引擎。通过三种互补搜索模式 — FTrees（药效团骨架跃迁）、SpaceLight（指纹近邻搜索）、SpaceMACS（子结构挖掘）— 在数分钟内从数十亿可合成化合物中精准定位目标分子。
核心理念：在已知的可合成宇宙中导航，而非盲目枚举。
深入了解 infiniSee →SeeSAR 工具生态
集成于 SeeSAR 平台的核心算法引擎，覆盖结构导向药物设计的每个关键步骤
FlexX · 分子对接
增量构建算法驱动的超高速对接引擎，分钟级筛选大型化合物库。支持标准对接、模板对接与共价对接三种模式。
HYDE · 亲和力打分
基于物理原理的结合自由能评估函数（无训练参数），原子级可视化脱溶惩罚与氢键贡献，绿色有利、红色不利，一目了然。
FastGrow · 片段生长
超快速片段生长工具，基于形状方向性描述符，数秒内筛选十万级片段探索结合口袋填充方案，适用于 FBDD 项目。
ReCore · 骨架跃迁
3D 骨架替换工具，通过检索来自 PDB、ZINC 等的 3D 片段库，为先导化合物快速寻找全新核心骨架，同时保持结合模式。
MedChemesis · 类似物生成
内置 290+ 种药化转化规则（生物等排替换、卤素引入、杂原子行走等），一键生成先导化合物的有潜力近邻分子。
FlexS · 配体叠合
基于物化模型的柔性配体叠合工具，无需蛋白结构即可将化合物与参考配体对齐，适用于基于配体的虚拟筛选和 3D-QSAR 准备。
infiniSee 搜索引擎
三种互补的化学空间搜索模式，适应不同的先导发现与优化场景
FTrees · 骨架跃迁搜索
基于功能树的模糊药效团相似性搜索，擅长跨骨架发现。保留药效团特征的同时探索全新化学骨架，分钟内检索十亿级化学空间。
Scaffold Hopper 模式SpaceLight · 近邻搜索
基于分子指纹（ECFP/CSFP）的快速类似物检索，在万亿级组合化学空间中秒级找到与查询分子结构最相近的可合成化合物。
Analog Hunter 模式SpaceMACS · 子结构搜索
基于最大公共子结构（MCS）的子结构挖掘引擎，特别适合 FBDD 中的片段装饰搜索，支持 SMARTS 查询语法。
Motif Matcher 模式Chemical Space Docking — 两大平台的桥梁
Chemical Space Docking (C-S-D) 是 BioSolveIT 的注册商标技术，也是连接 SeeSAR 与化学空间的关键桥梁。它将结构导向的分子对接直接嵌入组合化学空间，无需暴力枚举即可在数十亿可合成化合物中完成基于结构的虚拟筛选。
前端在 SeeSAR 中操作，后端通过 HPSee 接入高性能计算集群。普通 CPU 服务器即可运行，无需 GPU。
了解 Chemical Space Docking基础设施与扩展
支撑两大平台高效运行的基础组件
CoLibri · 化学空间构建
化学空间构建工具包。通过定义化学反应规则和构建单元，生成企业自有的组合化学空间，供 infiniSee 和 SeeSAR 搜索使用。
HPSee · 高性能计算
将 Chemical Space Docking 计算任务分发至 HPC 集群或云端的调度中间件，实现从桌面到超算的无缝扩展。
ModelRunner · ADME 预测
由 Optibrium StarDrop 提供支持的 ADME 属性预测模块，实时预测 BBB、hERG、logP 等 13 项参数。可集成于 SeeSAR 与 infiniSee 中使用。
药物发现工作流中的工具定位
从靶点到候选药物，每一步都有对应的工具支持
靶点准备
SeeSAR
蛋白模式
虚拟筛选
FlexX 对接
C-S-D 化学空间筛选
命中评估
HYDE 打分
ModelRunner ADME
先导优化
FastGrow · ReCore
MedChemesis
化合物采购
infiniSee 导航
可合成化合物直采
快速选型指南
根据您的研究场景选择最合适的工具
| 应用场景 | 推荐工具 | 说明 |
|---|---|---|
| 已有靶点结构，需要对接打分 | SeeSAR（FlexX + HYDE） | 交互式 3D 对接与原子级打分可视化 |
| 从已知活性分子出发寻找新骨架 | infiniSee（FTrees） | 药效团相似性驱动的骨架跃迁搜索 |
| 需要对数十亿化合物做结构虚筛 | Chemical Space Docking | 化学空间中直接对接，无需枚举 |
| 寻找已知化合物的可合成近邻 | infiniSee（SpaceLight） | 指纹近邻搜索，结果可直接采购 |
| 片段命中后需要生长优化 | SeeSAR（FastGrow） | 秒级片段生长与口袋探索 |
| 构建企业内部化学空间 | CoLibri | 自定义反应规则 + 构建单元 → 专属化学空间 |